“蛋白折叠问题”（protein folding problem）和“相问题”（phase problem）对生物学家来说是有名的难解之谜 。Qian等人利用一种新的计算方法来优化蛋白的三维结构模型 。当用来优化由NMR数据生成的模型时，他们的方法能提高这些模型在骨干构型和核心侧链位置上的准确性 。这种方法可被用来生成用于解决分子置换试验中的X-射线晶体学相问题的明显更好的解决方案，同时还能产生可用于分子置换的一个蛋白结构预测结果 。

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