利用取自50多位患者的病毒的基因序列，科学家跟踪了在中国流行时SARS病毒进化的三个不同阶段 。该研究描述了这种病毒从动物宿主跃迁到人类身上后在适应人类的过程中的基因变化 。对于制定先发制人的战略、开发疫苗和其它治疗方法来说，这种类型的信息是非常重要的 。赵国屏和他在中国SARS分子流行病学协作组的同事报告说，在流行病的初期，基因变化的特点是在某些热点的快速突变，引起病毒穗状蛋白质中的氨基酸的变化，这是病毒能粘附在宿主细胞上所必须的 。发生在香港的“超级传播者事件”是第二阶段的标志，病毒的变异率在这一阶段下降 。在最后的阶段，一个优势的基因型最终出现 。
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