如果说基因组像一本书 ， 那么科学家目前已能读出几种生物中的大部分单词，也就是基因 。但是要理解其中的含义 ， 科学家将不得不弄清这些单词是如何组成句子的 ， 也就是说这些基因做什么 ， 它们的指令是如何实现的 。一个研究小组通过研究由一组线虫基因编码的蛋白质产物的相互作用正在开展对这个问题的研究 。线虫的基因组已全部测序 。Walhout等人用一种新的方法(该方法应该能使研究整个线虫基因组的“语法”成为可能)，集中研究了涉及线虫阴门发育的27个基因 。他们能描绘出已知的和可能的新蛋白质的相互作用并注释了约100个先前未区别的基因产物 。在相关研究评述中，Kim指出，因为哺乳动物和线虫拥有许多相同的基因，线虫蛋白的相互作用图将有助于发现哺乳动物中类似的相互作用 。
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