科学家破译树鼩基因组 _树鼩

树鼩
近日，中科院昆明动物所、深圳华大基因研究院等单位对树鼩进行了全基因组测序，并对其分类地位和相关生物学特征进行了深度解析。业内专家认为，该研究解决了长期以来学界关于树鼩与灵长总目的系统发育关系的争议，为其在生物医学研究中用作动物模型奠定了重要的遗传学基础。相关研究成果日前在线发表于《自然—通讯》杂志。
树鼩也会感染人类乙丙肝
树鼩是一种分布于南亚、东南亚及我国西南地区的小型哺乳类动物。由于其个体较小、繁殖周期较短、养殖成本低以及与灵长类动物近的亲缘关系，一直被提议作为新型实验动物用于生物医学研究。
近几年，许多研究人员对树鼩发生了兴趣，认为它是一种很好的实验动物，可以像小白鼠等，为研究人类疾病提供帮助。很多报道表明，人类乙肝病毒和丙肝病毒能够感染树鼩，因此树鼩也常被用于乙肝和丙肝病毒感染的动物模型研究。
目前对树鼩的研究，大多集中在它是否能感染某种人类疾病，并能否进一步建立动物模型的研究上；而对于为什么能建立这些疾病的树鼩动物模型，遗传学上的“原因”是什么，还没有清楚解释。
为此，中科院昆明动物所动物模型与人类疾病机理重点实验室、深圳华大基因研究院等单位合作，通过基因测序，一方面给树鼩在分类学上定位，另一方面寻找遗传学上的“原因” 。
研究证明它与灵长类很“亲”
一只来自云南的树鼩，接受了全基因组测序。之后与多个物种基因组进行了比较分析，从全基因组基因序列比较角度重构了树鼩与其他物种的系统发育关系，证实了树鼩与灵长类亲缘关系最为接近。
【科学家破译树鼩基因组】通过对树鼩基因家族的系统分析，发现树鼩基因组中很多基因家族发生了扩张，例如免疫球蛋白λ轻链（IGLV）基因家族等。IGLV基因家族的扩张，将会阻止并消除病原菌。此外，树鼩基因组中出现了一些假基因和基因丢失现象，比如前列腺特异性转谷氨酰酶4基因（TGM4）参与调节精液凝结的形成和溶解。研究人员还发现有一些重要功能基因出现了提前终止或者移码突变。这些现象较好地解释了某些树鼩的特定生物学特性。
研究找到树鼩遗传学基础
研究人员还找到了为什么利用树鼩可以建立抑郁症、乙肝和丙肝等疾病的动物模型。
研究人员在树鼩基因组中鉴定出23个已知的神经递质转运蛋白。有研究表明，某些神经递质转运蛋白是抗抑郁药物的重要靶点，可以通过抑制其活性实现对抑郁症患者的治疗。树鼩基因组中发现的这种完整而保守的神经递质转运蛋白，为树鼩作为抑郁症模型研究以及抗抑郁药物研制提供了重要依据。
通过对树鼩的免疫系统相关基因进行研究，发现与乙肝及丙肝病毒感染相关的基因，在人类和树鼩中具有高度一致性，但树鼩基因组中出现了DDX58基因的缺失，该基因具有诱导产生针对病毒的干扰素的作用。研究人员推测该基因功能的缺失可能与树鼩的易感有关。

春城晚报杨质高