真菌感染给它寄宿的草带来了有利的影响 ， 但这可能是导致一种不利的生态现象──植物多样性损失的原因 。多样性的损失一般被认为受大规模生态和进化相互作用的影响，直接引起了本土物种的灭绝和可能的生态食物网的破缺，这是植物保护面临的一个重要问题 。欧洲一种叫羊茅（fescue）的草正逐渐侵入美国东北部，它的兴盛得益于它与其组织内生长的一种真菌的共生 。羊茅的活力增加，而且耐干旱，它的种子甚至对草食动物具有更大的毒性 。Clay和Hoalh种植了几块地的混合植物 ， 其中包括受到真菌感染和未受真菌感染的羊茅 ， 来判断羊茅中的真菌是否影响到了羊茅周围的其它植物群体 。结果表明，在受到真菌感染的地当中，羊茅占统治地位，其它植物种类受到排斥，从而减少了整个植物种类的多样性 。
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