“解释眼睛”是对演化理论的经典挑战，也是一个自达尔文时代以来在很多场合曾被回答过的挑战，即小变化的逐渐积累导致形成一个显然很复杂的器官 。验证达尔文进化论的另一个办法是采用数字生物 ， 即可自行复制、突变和演化的电脑程序 。在Avida软件平台（http://dllab.caltech.edu/avida/）上运行的数字生物种群常常演化出进行复杂逻辑运算的能力，这些逻辑运算要求协调地执行很多基因组指令 。在某些情况下，甚至那些首次出现时是有害的突变在复杂特征的演化过程中也会起铺路石的作用 。

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