近年来对来自海床下面深层的沉积物样品所做的研究工作，显示了一个以前隐藏的、巨大的深层微生物细胞生物圈 。钻探考察的结果表明，这种生态系统包含一个相当多样化的细菌（Bacteria）和古细菌（Archaea）种群，但这两组微生物中哪一组居支配地位却一直是一个非常有争议的话题 。根据对脂质（它们能够反映在来自大范围亚表层环境的亚表层沉积物中存在活细胞）所做研究进行的一项新的分析表明 ， 在这个生态系统中居支配地位的是古细菌，而不是细菌 。根据这项工作 ， 研究人员还对该生物圈的大小做出了估计：其大小约为900亿吨 。这个估计值与根据其他数据所做估计是一致的，基本上相当于全球植物生物质总量的1/5 。
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