深海沉积物含有大量以微生物质形式存在的碳 ， 这一生态系统的动态只是到现在才正在被确定 。Nature上的一篇论文指出，在一个大面积的沉积物真核生物群落中，古细菌相对于细菌来说居支配地位 。在Nature上，Danovaro等人报告了病毒感染在这一生态系统中的影响 。来自232个沉积样品的数据表明，病毒的产量是非常高的 。病毒感染能使真核生物质产量减少80%以上（在1000米深度之下接近100%），从而将大量溶解的有机碳释放进深海中 。在因其他原因缺乏资源的水域，营养物的这种注入尤为重要 。因此，病毒在全球生物地球化学循环、深海代谢和我们生物圈最大生态系统的总体功能方面似乎扮演一个重要角色 。

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