尽管能够催化将多肽折叠成其最终天然构象的反应的分子伴护系统很复杂，但蛋白误折叠仍会出现 。细胞的健康状况取决于它怎样剔除误折叠的蛋白 。Kaganovich等人发现 ， 酵母和哺乳动物细胞有一个细胞质量控制通道，该通道能够将可溶的和不可溶的蛋白聚合体区分开来，并将它们引导向两个包裹体当中的一个 。能够被蛋白酶体降解的或能够被重新折叠的可溶误折叠蛋白，将被作为目标，引导到一个并列核质量控制腔中；包括与疾病相关的亨廷顿蛋白和锯蛋白在内的不可溶的蛋白聚合体，将被封存在一个与自噬性通道相关的胞液包裹体中 。
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