物种起源的遗传基础是什么？经典的达尔文“小突变”观点是 ， 一个新物种通过很多基因上所发生的小突变的累积而与其先祖有所不同 。但是有很多例子支持“大突变”理论，该理论认为，关键的差别在于突发的大变化，尤其是发育中所涉及到的基因的变化 。看来，答案似乎是两种极端情况的一种综合 。McGregor等人对shavenbaby基因进行了仔细研究 ， 该基因已知是造成不同种类果蝇之间在硬毛分布模式上的差别的基因 。他们发现 ， 产生不同物种所特有的硬毛分布模式需要三种截然不同的基因增强子之间的相互作用 。他们得出结论认为，区分不同物种的大效应基因有时可能反映了在几种特定基因上所发生的多种小效应突变的积累 。所以 ， “小突变”观点与“大突变”观点之间的历史分歧，可能仅仅代表着从不同尺度来看同一数据而得到的不同观点 。

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