通过基因组印迹进行基因调控（基因的活性取决于它来自父方还是母方）既见于哺乳动物 ， 又见于开花植物，然而新印迹位点怎样能够随着演化时间的推移而出现仍然不清楚 。现在，对拟南芥中三个“Enhancer of zeste-like”基因演化所做的重建表明 ， 留下印迹的MEDEA 基因是在大约3500万年前通过全基因组复制从Brassicaceae中的SWINGER基因出现的 。所以MEDEA 基因（是种子发育所必需的）在开花植物演化过程中出现的相对较晚 。MEDEA 是由于积极的达尔文选择（自然选择）而留下印迹和获得其新功能的，而SWINGER则保留了祖先功能，没有留下印迹 。
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