很多生理参数，如体温、血糖和心率，随生理时钟的24小时节律发生周期性变化 。代谢通道与生理时钟是怎样耦合到一起的一直是一个谜，但现在用小鼠所做实验表明，代谢转录调控因子PGC-1alpha是一个关键因素 。缺少PGC-1alpha的小鼠表现出异常的昼间活动节律、体温和代谢速度 。在机械层次上，PGC-1alpha通过ROR家族的孤核受体的共激发来调控时钟基因表达 。
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