现代形式的哺乳动物是在非鸟类恐龙于距今6500万年前灭绝之后突然出现的、还是花了较长时间才有了其现代特征?关于这个问题的争论还在继续，古生物学家一般倾向于认为它们是突然出现的，而分子系统发生遗传学家则认为哺乳动物的根源要深得多 。Olaf Bininda-Emonds等人利用大量分子数据发现 ， 不仅哺乳动物的演化有很深的根源，而且现存的哺乳动物的一些目是在恐龙灭绝之后数百万年才出现在地球上的 。在白垩纪末期发生的大灭绝对于哺乳动物的演化几乎没有可以辨别出的影响 。
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