酸性矿山排出物的形成是最普遍和最严重的环境问题之一 ， 是由微生物群落调控的，这些群落经常为II-类钩端螺旋菌属（Leptospirillum group II）所支配 。这些微生物生长在pH值一般低于1.0、富含有毒金属的硫酸溶液中 。来自美国加州Iron Mountain被废弃的Richmond矿的生物膜 ， 是研究这些重要微生物群落的理想材料，因为它们所包含的物种数量相对很少 。一项高分辨率蛋白组-基因组学（proteogenomic）研究表明 ， 在彼此关系密切的细菌种群和在生物个体之间大量的基因变种交换，是它们适应这一严酷生态环境的关键 。这项工作是在微生物的自然环境中对它们进行研究方面的一项重要进展，这种蛋白组-基因组学方法在其他方面也应能够找到用途 ， 比如说在对病原体的分类中 。

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