Proteorhodopsin对生活在海洋有光区的海洋微生物来说非常有用 。在一个能够立即停止光合作用、但在光照充足的表面水域足以让一种生物具有竞争优势的过程中,这种蛋白能将光转变为细胞能量 。事实上,Proteorhodopsin似乎更能代表这种独特的环境,而不是在其中发现它的生物 。对在夏威夷附近海域收集到的海水所做的DNA甄别表明,该蛋白的基因为古细菌(Archaea)和细菌家族的成员所共享 。古细菌和细菌是两个完全不同的微生物生命形式 , 它们通过横向基因转移在海洋有光区内共存 。
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