推断基因组内容的方法

人们经常会读到利用基因组序列数据来推断一种生物怎样生存的论文,不常见的是Nature上报告的一组科学家所采用的方法,他们为一组具有类似生活方式的相关的生物生成了基因网络,并利用这些网络来推断该组生物中另一成员的基因内容 。以大肠杆菌的基因组为出发点,他们预测出了Buchnera(一种细胞内共生体,具有一个内容大大减少的基因组)的代谢方式,该细菌是从大肠杆菌的一个祖先演化来的 。这项工作对于寻找一个“最小的基因组”的工作有参考价值,而且已经表明,所谓的“非必需基因”的概念可能是谬误的,因为一个基因在变化中的基因组背景下可以很容易变成必需的基因 。