鳃囊见于现存的“圆口纲脊椎动物” (八目鳗类鱼和七鳃鳗)和它们的化石祖先 。人们早就怀疑所有无颌脊椎动物都有这种鳃囊，但一直缺乏确凿的证据来支持这种观点 。现在，研究人员在一个保存完好的、距今3.7亿年前的Endeiolepis化石中发现了七鳃鳗一样的鳃 。这种动物被称为“裸露的无甲类”，因为其身上没有鳞片 ， 所以可能是滑溜的 。无甲类是处在演化树根部的有颌类，即与有颌脊椎动物的关系比与圆口纲脊椎动物的关系更近的无颌脊椎动物 ， 所以该发现说明，鳃囊过去曾存在于所有脊椎动物的最后一个共同祖先身上 ， 后来在有颌脊椎动物身上消失了 。
【所有脊椎动物的最后一个共同祖先有鳃囊】
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