给所有活的东西建一个生命之树是系统分类研究人员面临的一个挑战 。Antonis Rokas在本期一篇研究评述中写道，虽然第一个基因组是在10年前的测定，但是基因组已经对系统分类有了很大的影响 。基因组数据使研究人员发现了建立生物之间早期关系的新的标记 。大量的数据给系统分类建设的推断以更多的信心，但也带来了挑战 。研究人员需要更大的计算机和新的统计算法来处理这些数据 。有些棘手的问题也变得更清楚，包括某些基因历史看起来更像进化网络而不是树 。比较基因组学将使可以得到的分子数据极大地增加，从而在组建一个更清晰的生命之树上起关键作用 。
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