一个通过切开DNA股来改变DNA排列从而帮助DNA复制以及染色体分离的酶也在转录激活中其作用，转录激活是为下一步的蛋白生产将DNA转变为RNA的过程 。Bong-Gun Ju和同事现在显示，通过核受体和其它类型的转录因子的基因转录激活需要拓扑异构酶topoisomerase II-beta ， 该酶在基因的特定位置产生双股DNA的断裂 。研究人员发现，DNA断裂发生后，其它DNA修复酶参与进来帮助将基因暴露给转录机器 。Jean-Francois Haince和同事在一篇相关的研究评述中讨论了这一发现 。
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