尼日利亚是2006年2月报告H5N1禽流感紧急情况的第一个非洲国家 。该国所面临的风险尤其大，因为它从全世界进口鸡，而不进行严格的生物安全防护 ， 而且沿着将尼日利亚与俄罗斯南部和西亚连接起来的迁移路经有很多鸟类避难所 。现在，对来自拉格斯州被感染家禽的H5N1的DNA序列所做的一个分析表明，野生鸟类是该病毒的可能来源 。三个H5N1病毒品系似乎是由候鸟独立引进的 ， 虽然独立的贸易进口也不能排除 。
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