由II-类RNA酶家族的成员对RNA的降解，在RNA的成熟、周转和质量控制中起着根本性的作用 。现在，一种RNA酶-II的晶体结构已被首次确定 ， 它以两种形式存在：一种是与RNA结合的形式，另一种是没有配体的形式 。出乎意料的是，该结构并不与序列分析所预测的结构相对应 。该分子有两个点与RNA相接触：一个点固定RNA ， 另一个点催化解理反应 。该结构细节可解释为什么RNA酶-II只对单链RNA发生作用，也可解释它是怎样沿RNA前进、并逐渐对其进行降解的 。
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