黑猩猩和人类的基因组有98%到99%是相似的，但这个撩人的1%到2%的差异同样地引起研究人员和外行们的兴趣 。现在人类基因组序列的草图已经得到的了 ， 科学家们准备将两者做彻底的比较 。Asao Fujiyama和一个国际研究小组的研究人员已经将超过60万个黑猩猩DNA序列的片段与人类基因组序列比较做图，在两者之间寻找重要的差异（特别是基因组内的重组） 。研究人员发现了几个可能的位置，包括人类21号染色体上的两个簇（clusters），这里有黑猩猩和人类基因组之间大的、非随机的差异 。
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