核反应的废料或者是原样储存起来；或者是经过再加工 ， 使钚和铀分离出来 。然后，钚能作为燃料被重复利用 ， 但是也能被用于制造核武器 。在过去的几十年中，美国反复在“再加工用过的燃料”和“不分离废料”这两个选者之间转变，采用后者是为了减少钚可能落入坏人之手并被用于制造核武器的危险 。在这期的政策论坛中 ， Frank von Hippel论述了美国副总统Dick Cheney最近的一篇报告，该报告建议美国恢复对再加工的支持 。一种新的“高温处理（pyroprocessing）”方法的支持者说，这种方法可以让钚以一种不适合被用于核武器的形式被分离出来 。但是Von Hippel认为，从经济、防止扩散和环境的角度看，简单的“一次使用”燃料的方式是更可取的 。

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