透明的斑马鱼体内带有荧光标记的脂类化合物（或称为脂肪）正使得研究人员们能够分析在脊椎动物的消化系统中这些脂肪是怎样被处理的 。科学家们希望这些荧光报道基因能够引导他们找到导致胆固醇过量生产和动脉硬化症等一些脂类代谢紊乱的基因 。这些生理紊乱并不表现为消化系统自身结构的问题，因此对它们进行研究比较难 。Steven A. Farber和同事们用带有“关闭的”荧光标记的磷脂喂斑马鱼幼虫，并在消化活动对磷脂进行转化和转运时监视荧光的启动 。这种方法使研究人员能够观察人类胆固醇阻碍物(blockers)对脂肪处理过程的影响，并帮助他们找到了一个他们称为“fat free”的斑马鱼的突变，该突变显示出严重降低的脂肪和胆固醇的处理能力 。
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