L.L. Wolfenbarger和P.R. Phifer在这篇综述文章中说，对有关转基因作物的科学文献的回顾表明 ， 缺少有关它们对环境危害和益处的关键的实验 。他们讨论了涉及入侵危害、对非目的有益生物(从蝴蝶到甲虫到土壤微生物)的影响的研究，也讨论了对证明减少使用杀虫剂、提高产量、环境资源保护甚至是由此带来的污染减少等益处的研究 。这些研究显示，转基因植物的利与弊可以在不同情况下有很大的不同，取决于作物、被改造的特征、以及它们与生态系统其它部分复杂的关系 。
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