在监测了来自水稻田的甲烷及甲基卤化物气体的散发之后，研究者们估算出了水稻对于这些大气中重要气体的额度所做出的贡献 。甲烷是一种有效的温室气体；甲基卤化物，例如甲基氯、甲基溴和甲基碘，参与了破坏臭氧层的反应 ， 以及大气层中另一些重要的化学反应过程 。《蒙特利尔协议》已经限制了许多卤素化合物(包括氯、溴、碘等)的人工制造，不久，天然过程将会成为大气中的某些卤素气体中的主要来源 。根据对水稻排放甲烷和甲基卤化物的观测，K. R. Redeker及其同事计算得到：大气中大约1%的甲基溴和5%的甲基碘来自世界各地的水稻田 。他们同时也发现，甲烷和甲基卤化物是由不同的微生物代谢过程而产生的 。
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