从众多基因组中挑出一种新的基因组 _海洋

【从众多基因组中挑出一种新的基因组】

图形视图为海洋微生物群落中的组装宏基因组DNA序列
单独一滴海水中常常就会充斥着微观生命。但是传统上，要分离出某单一物种并给其整个的基因组测序一直是极端困难的。如今，研究人员说，他们研发出了一种从一个大型的、有着许多生物的宏基因组样本中将某单一基因组解析出来的方法。
Vaughn Iverson及其同事从华盛顿州的普吉特湾中收集其中含有数百万计的微生物的表层海水，并在他们的样本中找出了一种特别的微生物——海洋II组广古生菌。这一相当神秘的古细菌门以前从来没有被培养过，而研究人员所收集的其基因组材料只代表了其整个宏基因组样本的1.7% 。然而， Iverson及其同事仍然能够从他们在普吉特湾海水中分离出的零零星星的片段中拼凑出一个几近完整的广古生菌的基因组。显然，这些生物是能动的，并与细菌进行了广泛的基因交换。
据研究人员披露，该新的基因组还提供人们有关变形菌视紫红质——这是某些细菌用来从阳光中收获能量的一种分子——起源的某些端倪。Iverson及其同事提示，他们的从宏基因组样本中分离个别基因组的方法可能对发现还未培养的微生物在我们的环境中所扮演的不同作用有帮助。

EurekAlert!