生物膜是生长在一个表面上的有组织的细菌群落，它们对抗菌素具有抵抗力，例如在对假单胞菌(P. aeruginosa)生物膜感染敏感的囊性纤维瘤患者身上就是如此 。现在，微阵列技术被用来研究自由生活的假单胞菌和生物膜假单胞菌之间的区别以及生物膜对抗菌素具有抗性的遗传基础 。一些微生物学家曾预测 ， 自由生活的假单胞菌和生物膜假单胞菌的基因表达有着全面的区别，但只有1%的基因表现出一种分异的表达 ， 只有有限的20个基因被发现是被某种抗生素的存在诱导的 。
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