免疫细胞通过分泌由NADPH氧化酶复合物产生的活性氧核素来吞噬入侵的微生物 。NADPH氧化酶跨越细胞膜移动电子，在目标微生物附近形成毒性超氧化物阴离子 。与NADPH氧化酶相关的质子通道蛋白分子的性质是一个有争议的问题 。对人体嗜中性细胞中的NADPH氧化酶的电流-电压关系所做的新的测定表明 ， 在该蛋白通道与该氧化酶之间没有直接联系 。相反，质子的运动还可通过防止也许会有抑制作用的膜去极化来增强NADPH的活性 。
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