此前，细胞色素b6f是原子结构未知的最后一个主要的含氧光合作用复合物；现在，研究人员通过X-射线衍射，以3.1埃的分辨率获得了该物质的原子结构 。细胞色素b6f参与在光合体系-I和光合体系-II之间转移电子，从而在不同光照条件下平衡它们的活性 。该物质还可利用这些电子的能量来将质子抽过叶绿体的膜 。这一结构显示出两个功能仍然不清楚的共因子，即叶绿素- a和胡罗卜素 。该结构还显示存在一种以前未曾料到的第四种血红色，该血红素的中心铁原子处在一个不寻常的坐标点上 。这一特点以及该血红素在该细胞色素中的位置，使得它成为电子转导中的一个关键中间体 。
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