为什么哺乳动物身上会有大量共生细菌生存?这些细菌又是怎样到它们身上去的?微生物学家正在开始了解这些问题 。但是,将有益细菌与有害细菌区分开来的是什么仍然不大清楚 。2005年,研究表明 , 小肠菌Bacteroides fragilis对哺乳动物免疫系统有深远影响,这种影响归于一个分子,即荚膜“多糖体-A”(PSA) 。现在,B. fragilis PSA被发现能够在一个涉及可产生T-细胞的白介素-10的过程中保护动物不患细菌性和化学性结肠炎 。这表明,B. fragilis通过抑制小肠炎症反应来帮助维持人体健康,共生因子也许能为寻找新疗法提供一个途径 。这个领域的工作正在得到以确定人体微生物环境性质及确定它在健康与疾病中所起作用为目的的几大研究项目的推动,其中包括“人类微生物组项目”(Human Microbiome Project) 。在News Features文章中 , Asher Mullard(p. 578)对不同的研究方法进行了分析;Apoorva Mandavilli(p. 581)报告了在小肠移植后从头开始观察肠道被细菌占据的一个难得机会 。
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