最近的基因组研究表明，很多物种不同个体之间大块DNA片段有所不同，而且这种差异集中在突变热点上 。利用包括酵母、水稻、果蝇、啮齿类和灵长类在内的10个基因组，对插入和删除（统称为“indels”）周围的单核苷酸取代的分布所进行的6个成对比较表明，遗传变异的水平在所有对比中都与距“indels”的距离呈强烈负相关 。而且，“indels”的大小和丰度显著影响局部核苷酸多样化水平 。这项工作表明，“indels”是诱发突变的一个共同机制，并且在基因组演化中可能扮演一个重要角色 。

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